Греческая аутосомных ДНК

479356_572325192802072_923512851_o
по Dienekes усваивалось

Ярким проявлением сохранение греческого генетические подписи через время можно найти в [1]. Рисунке справа 4-главный компонент изменения в Европе и показывает сильную Клайн, сосредоточена в Греции. Это не только греческий генетическое наследие четко хрусталику сегодня, но это хрусталику среди не только греки, но всех их соседних популяций частичной греческого происхождения:

Рисунок 2. Скрытые шаблоны в географии Европы, свидетельствуют первые пять основных компонентов, объясняя соответственно 28%, 22%, 11%, 7%, и 5% всего генетические вариации для 95 Классическая полиморфизмы (1, 13, 14). Первый компонент — почти superimposable археологические даты распространения земледелия с Ближнего Востока между 10,000 и 6,000 лет назад. Второй основной компонент параллели вероятного распространения уральских людей и/или языков на северо-восток Европы. Третий очень похож на распространение пастырское кочевников (и их преемников) кто домоседкадомосед лошади в степи в конце расширения сельского хозяйства, и считает, некоторые археологи и лингвисты распространились большинства индоевропейских языков в Европу. В-четвертых, сильно напоминающая греческой колонизации в первом тысячелетии до Н.Э.. Пятый соответствует прогрессивной отступление границы баскского языка. Баски сохранили, в дополнение к их язык, считается, что потомками оригинальный язык, распространённый в Европе, Некоторые из их оригинальных генетических характеристик. (От ref. 1, с разрешения Princeton University Press, изменения.)

Генетическое родство человеческих популяций может определяться путем изучения большого числа полиморфизмы. Например, Аюб и др.. [2] используется 182 Tri- и Тетра аутосомно микроспутников, что позволило им создать следующее дерево, основанное на DКАК Генетическое расстояние между выборку населения. Ясно, что греки относятся к европеоидной группе населения (охватывающий группы от «Европейский север» до «Burusho» на рисунке), и четко отграничены от Азии/Океании/американский кластера («Камбоджи"в «Индейцев майя»), и даже больше от Африканской группы («Сан» до «Заир пигмеев»).

Современные исследования аутосомных ДНК опираются на изучение большого числа сингл нуклеотидных полиморфизмов (ОНП), т.е., изменения в одной буквы генетического кода. Недавнее исследование [3] используется 10,000 такие полиморфизмы для изучения генетической структуры населения Европы, включая образец греков. Были использованы два различных методов: анализ главных компонент (СПС) , что найти наиболее важные размеры, резюмируя изменчивости генетических данных, и структура широко используется на основе модели кластеризации программа, который назначает лиц количество различных кластеров K.

Результаты выполнения структуры изображены ниже.

 

Для каждого количество кластеров (K), каждой группе назначается цвет. Каждый из исследуемых популяций соответствует вертикальной линии, и состоит в различных пропорциях различных кластеров. Мы отмечаем, что греческие лица принадлежат к основной европейский-Запад Азии-Северной Африки (Кластер) кластер для K до 5. В K = 6 “Средиземное море” маленький кластер (Грин) выходит, который охватывает особенности населения, граничащих с Средиземного моря, а также армяне. В частности, Мы отмечаем, что нет никаких видимых вклад Евразийского Востока (Монголоидов) розовый кластера или из Африки к югу от Сахары (Негроидная раса) красный кластер.

Ниже показаны результаты СПС для первых двух основных компонентов.

 

Каждый бар соответствует населению, и его ширина охватывает изменчивость различных выборки индивидов внутри каждой популяции. Первый основной компонент (PC1) отделяет к югу от Сахары африканцев (Менде и Burunge) от евразийцев. Второй основной компонент (PC2) отделяет монголоидов и индийцы (Алтай, Брахман, и мала) от других групп населения. В обоих, Очевидно, что греческий лиц exhibit обычно Западный Евразийский (Европеоидной) Геномный профиль.

В то время как выше исследования изучили структуру мирового населения, более недавние исследования были сосредоточены на выявлении тонкой структуры внутри популяций европейского происхождения сами. Например [4] изучал происхождение европейских американцев с помощью 583 SNP маркеры. Авторы определили, что главной особенностью европейских американских вариации clinal по оси юго-восток-северо-запад, вывод, который подтверждает вышеупомянутые работы Кавалли-Сфорца [1] на основе классических маркеров. Второй наиболее примечательной чертой отделяет Юго-Восточной Европы от ашкеназских евреев. Греческий лица этого исследования, как их итальянские коллеги имели типичные характеристики Юго-, и были четко отделены от ашкеназских евреев.

 

Еще одно исследование, [5] считается большее количество полиморфизмов, с аналогичными результатами. Снова, Главной особенностью вариации отделены населения из Северной Европы и те из Южной Европы, во время второго участника проводится различие между Южной европейцы и евреи-ашкенази. Греческие люди были ближе к Италии из них.

 

 

Еще одно исследование [6] изучал более чем 2,500 Европейцы, с использованием чип Affymetrix 500,000-маркер; Это самые обширные и подробные примеры европейских аутосомно-вариации еще. Авторы делают вывод, что уровень гетерозиготности и связь дисбаланс наблюдается в Южной Европе согласуются с урегулированием континент разбирательства с юга на север. Европейцы форма, за исключением финнов, генетические континуум. Члены каждой этнической группы кластера вместе, и частично перекрываются с соседними группами, но может быть полностью отличать генетически от более далеких из них.Эти результаты показывают, как относительная однородность Европейский генофонд, а также тот факт, что они могут отличаться сильно генетически вместе географически и даже этнических линий.

 

 

В исследование были включены образец 51 Северный греки. Очевидно, что эти греки (отмечен EL), форма однородного кластера, ни один из них падает в середине кластеры, образованные другими этническими группами. Некоторые из бывших югославов (отмечен ю.) осенью в центре греческой кластера, однако. Эти бывшие югославы, а также две группы Италии (IT1 и IT2) форма греки’ ближайшими соседями генетических. Югославов находятся между греки и чехи и поляки, в соответствии с их наличием обоих коренных народов балканских и балканских славянских происхождение; Итальянцы, греки и испанцы, в соответствии с тем, что их вклад Восточного Средиземноморья, возможно из-за неолитических фермеров, или древних (Например. Греческий или этрусков) колонистов.

Вскоре после предыдущего исследования появилась, еще одна статья [7] используется тот же чип Affymetrix 500K через образец 3,192 лица, включая 8 Греки. Хотя многие из выборки населения представлены небольшим числом лиц, Таким образом затрудняет обобщение, Очевидно, что первые две основные компоненты несут еще сильнее отношения к географической карте Европы. Это вероятно стало возможным путем включения более широкого круга населения, в том числе многие из Восточной Европы.

 

 

С оговоркой о небольшой численности выборки, Эти результаты довольно согласуются с данными предыдущего исследования. Греки (GR) еще раз между их северных соседей (особенно албанцы (АЛЬ), Slavomacedonians (MK), Болгары (BG), Румыны (RO), и косовары (KS)) и итальянцы (ЭТО). Греков-киприотов (CY) и турки (TR) также кадр греческого образца на более южные и восточные направления соответственно. Греки’ ближайшими соседями, как представляется, их ближайших северных соседей, а также некоторые из итальянцев которые в противном случае представляется вполне переменной, Некоторые из них больше похожи на их центральных европейских соседей; Северные балканские славянского населения (Словенцы (SI), Хорваты (HR), Боснийцы (БА) появляются более отдаленные, в направлении Центральной и Восточной Европы славян.

Исследования, такие как выше [4-7] показали, что в первых двух основных компонентов лиц из разных европейских групп, как правило, кластер друг с другом. Однако, Эти компоненты захватить только частью общей генетической изменчивости: наиболее характерными часть, которая связана с географии и этнической принадлежности. Новое исследование [8] расследование общее генетическое сходство отдельных европейцев, с помощью набора данных, также используется [6]. Для каждого человека, Кому “Лучший общий матч” (СПЕЦИФИКАЦИИ), т.е., наиболее близок к его личности была рассчитана на все маркеры. Результаты приведены в таблице ниже:

Каждая строка в этой таблице показано происхождение этих спецификаций. Как отмечают авторы “в значительной части случаев (76.0%), Спецификации данного индивида, основанный на наборе полный маркер, пришли с сайта набора кадров чем человек сам“. Например, Финский (FI) Образец состоит из 47 лица: 39 из них имеют спецификации, которая также Финн, во время 1, 4, и 3 есть Норвежский (НЕТ), немецкий (ДЭ1), и польский (PO) Лучший матч. Важно отметить, как размеры выборки влияют на эти числа: есть 47 из 2,457 Финны в общей выборки (1.9%). Поэтому, Если финны были неотличимы от других европейцев, тогда можно ожидать, что только около 0.9 из них (1.9% из 47) будет иметь Финский спецификации. Таким образом, тот факт, 39 из них делают это весьма значительный (43 раза выше, чем шанс). Но, замечание остается в силе, что членом определенной группы может иметь “генетический двойник” из другой группы.

Обращаясь к грекам (ЭЛЬ, в Северной Греции), Мы видим, что они имеют спецификации из Норвегии, Швеция, Великобритания, Дания, Нидерланды, Германия, Австрия, Швейцария, Италия, и Греция. И наоборот, Спецификации некоторых Голландский, испанский, итальянский, и греческий лиц — Греческий. Общая, Греческий образец состоит из 51 лица, и поэтому один ожидает (случайно) что только 1.1 из них будет иметь Греческий спецификации. Таким образом, Греки имеют в 7 раз выше чем случайный шанс иметь малый греческого как их спецификации. Различные европейские группы существенно различаются в этом: вышеупомянутые финнов, как представляется, наиболее четко, с большинством из них, больше похож на совместное этнической чем для любых других европейцев. Другие группы, как представляется, будет меньше, так; Например не австрийцы (AT) у коллег австрийский спецификации.

Общих спецификаций греческой лиц отметить также потому что совпадения наблюдаются между греками и Восточной Европы или наоборот. Это, вероятно, указывает на отсутствие среди греков многих существенно “Слав как” лица; отдельные греки могут иметь “Подобные генетические” в далекой Британии и Скандинавии, но никто вообще в Восточной Европе. Действительно, они имеют больше чем случайное число матчей только с большой немецкий образец (ДЭ1) от киля, которая вероятно указывает на значительный неоднородность этого образца, члены которых служат тесные матчах многих европейских этнических групп. Исследование также включает в свой дополнительный материал, Таблица макет ложных положительный показатель среди населения различных пар; Это мера генетического расстояния между ними:

Для греческого образца, ближайшего населения являются югославов (Ю., 0.047), Итальянцы (HTS, 0.0049; IT1, 0.053), и австрийцы (AT, 0.054). Самый дальний из них являются финны (FI, 0.142), Немцы (ДЭ1, 0.117), нидерландский (NL, 0.112), ВЕЛИКОБРИТАНИЯ (ВЕЛИКОБРИТАНИЯ, 0.106), и норвежцы (НЕТ, 0.103). Этот шаг равносилен наблюдения в [6] в первых двух главных компонент, Греки находятся ближе всего к югославов и итальянцев среди исследуемых групп.

Автон и др.. [9] изучал образец греков из Греции и Кипра в глобальном контексте 3,845 лица на основе около 450K ОНП. Ниже показаны результаты анализа структуры, с увеличением числа кластеров, начиная с K = 2 (Верхняя строка). Изучал лица из Греции (#15) и Кипр (#9) появляются ничем не примечательный в этом анализе. Очевидно, что, по сравнению с населения во всем мире, изучал европейцы достаточно однородным, состоит главным образом из “красный” компонент, с без очевидной значительный вклад из исконных элементов типичных других континентальных групп.

Ссылки
  1. L. Лука Кавалли Сфорца, «Гены, народы, и языки,«Proc. Национальный исторический. Изд-во. Sci. США, Vol. 94, PP. 7719-7724, Июль 1997.
  2. Касим Аюб и др., «Реконструкция человеческого эволюционного дерева, с использованием полиморфных аутосомных микроспутников,” Американский журнал по физической антропологии, 122:259–268 (2003)
  3. Марк Bauchet и др., Измерение европейской стратификации населения, с использованием данных Microarray генотип, Американский журнал генетики человека (в прессе), (2007)
  4. Цена Аль, J Батлер, Паттерсон N, C Капелли, Паскали ВЛ, и др.. (2008) Взыскательных предки американцев европейского происхождения в ассоциации генетических исследований. PLoS генета 4(1): E236. дой:10.1371/Journal.pgen.0030236
  5. C Тянь, Plenge RM, Выкуп М, Ли A, Villoslada P, и др.. (2008) Анализ и применение европейских генетических каркаса с помощью 300 K SNP информация. PLoS генета 4(1): Е4. дой:10.1371/Journal.pgen.0040004
  6. Лаосская O. и др.. (2008) Корреляция между генетическими и географической структуры в Европе, Текущий биология дой:10.1016/j.cub.2008.07.049
  7. Novembre J. и др.. (2008) Гены зеркало географии в Европе, Природа дой:10.1038/nature07331
  8. Лу Tehva T. и др.. (2009) Оценка дизайна исследования генетических соответствует пара, с помощью данных генома SNP от Европейского населения, EUR J Hum генета дой:10.1038/ejhg.2008.266
  9. Автон A. и др.. (2009) Глобальное распределение геномного разнообразия подчеркивает богатую историю сложных континентальных человеческих популяций, Исследования генома, дой:10.1101/GR.088898.108

Добавить комментарий